Андрофлор

Зачем знать о рисках наследственных заболеваний

Человеческий организм состоит из триллионов клеток. Каждая играет определенную роль: отвечает за производство ферментов для расщепления пищи, транспортировку кислорода в крови или выполняет другие необходимые для жизни функции.

Большинство клеток человека содержит 23 хромосомы от матери и 23 — от отца. Всего 46 хромосом

Гены — участки ДНК, которые содержатся в хромосомах и передаются по наследству. У человека по разным оценкам 20–25 тысяч генов. Они изменяются при передаче потомству — во время деления клетки получают по одной хромосоме от каждой пары.

Изменения в генах, которые приводят к нарушению работы важных белков и развитию заболеваний, называются патогенными вариантами генов. В зависимости от  степени изменений в генах заболевания делят на следующие категории:

Наличие патогенного варианта гена только у матери или отца, не означает, что у ребенка обязательно проявится заболевание. Человек может быть здоровым носителем. Но если у обоих родителей одинаковый патогенный вариант гена, то риск рождения ребенка с заболеванием значительно повышается.

Одно из самых распространенных наследственных заболеваний в европейской популяции — муковисцидоз, при котором в легких и других органах скапливается слизь. Она блокирует легкие, поджелудочную железу и другие органы. По статистике в Европе один из 2 000–3 000 новорожденных появляется на свет с муковисцидозом. Только половина пациентов с этим диагнозом доживает до 18 лет, и только 5% — до 40 лет.

Наследственные заболевания часто не совместимы с жизнью, поэтому распространено мнение о том, что они не так часто встречаются. Но по статистике 1 из 50 людей рождается с моногенным заболеванием, в то время как у 1 из 263 есть хромосомные нарушения.

В мире живет более 70 000 людей с муковисцидозом.

При наличии у обоих родителей варианта гена, связанного с муковисцидозом, риск рождения ребенка с этим заболеванием — 25%. Если узнать об этом заранее с помощью генетического теста, можно вовремя принять необходимые меры, например, воспользоваться вспомогательными репродуктивными технологиями.

Как проводится взятие

При заболеваниях нижних отделов урогенитального тракта, таких как уретрит, баланопостит, берутся соскобы из уретры, крайней плоти головки полового члена.

Возможно тестирование мочи, но такой способ (порция утренней мочи более информативна) рекомендуется только при остром воспалении, когда нельзя травмировать уретру.

При заболеваниях верхних отделов, таких как простатит, бесплодие, орхит, берутся: секрет простаты, биоптат простаты, эякулят. Остаточная моча после массажа простаты малоинформативна. Следует отметить, что при подозрении на острый простатит массаж простаты делать запрещено.

Для сбора мочи и соскоба рекомендуется не мочиться пару часов. Моча смывает микрофлору из мочеиспускательного канала, в которой могут содержаться патогенные бактерии и различные клетки, необходимые для исследования.

Как проводится соскоб:

• При соскобе из уретры либо крайней плоти головка обрабатывается стерильным раствором. Это необходимо для уничтожения микробов, которые обитают на поверхности кожи.
• Для взятия материала используется специальный инструмент. Он вводится в уретру либо в крайнюю плоть на несколько сантиметров. Для того чтобы собрать нужное количество материала, производят несколько вращательных движений. Затем извлекают инструмент.

Для получения секрета простаты к вышеуказанным рекомендациям по подготовке к анализу добавляются следующие: не принимать пищу за 10 часов до исследования, использовать очистительную клизму.

Когда обращаться к генетику

Генетический тест Атлас включает бесплатную консультацию генетика, который помогает разобраться в результатах теста. Наши генетики специализируются на выявлении рисков наследственных моногенных и многофакторных заболеваний, и при необходимости посоветуют пройти дополнительную диагностику.

Дисклеймер: Генетический тест Атлас создан в информационных и образовательных целях. Только специальные диагностические тесты, назначенные врачом, могут подтвердить генетические риски.

Статус носителя не повод для беспокойства. Для большинства людей это не несет никакой угрозы и не значит, что заболевание обязательно проявит себя

Если результаты теста показывают носительство, на это стоит обратить внимание при планировании семьи

Этиология и патогенез

Муковисцидоз имеет аутосомно-рецессивный тип наследования

Ген, ответственный за муковисцидоз, был клонирован в 1989 году. Благодаря этому удалось выяснить природу мутации и усовершенствовать метод выявления носителей. В основе заболевания лежат мутации в гене CFTR, который локализован в середине длинного плеча 7-й хромосомы. Муковисцидоз наследуется по аутосомно-рецессивному типу и регистрируется в большинстве стран Европы с частотой 1:2000-1:2500 новорождённых. В России в среднем частота болезни 1:10000 новорождённых. Если оба родителя (являются носителями мутировавшего гена), то риск рождения больного муковисцидозом ребёнка составляет 25 %. Носители только одного дефектного гена (аллели) не болеют муковисцидозом. По данным исследований, частота гетерозиготного носительства патологического гена равна 2-5 %.

Идентифицировано около 2000 мутаций гена муковисцидоза. Следствием мутации гена является нарушение структуры и функции белка, получившего название муковисцидозного трансмембранного регулятора проводимости (МВТП). Следствием этого является сгущение секретов желёз внешней секреции, затруднение эвакуации секрета и изменение его физико-химических свойств, что, в свою очередь, и обусловливает клиническую картину заболевания. Изменения в поджелудочной железе, органах дыхания, желудочно-кишечном тракте регистрируются уже во внутриутробном периоде и с возрастом пациента неуклонно нарастают. Выделение вязкого секрета экзокринными железами приводит к затруднению оттока и застою с последующим расширением выводных протоков желез, атрофией железистой ткани и развитием прогрессирующего фиброза. Активность ферментов кишечника и поджелудочной железы значительно снижена. Наряду с формированием склероза в органах имеет место нарушение функций фибробластов. Установлено, что фибробласты больных муковисцидозом продуцируют цилиарный фактор, или М-фактор, который обладает антицилиарной активностью — он нарушает работу ресничек эпителия.

В настоящее время рассматривается возможное участие в развитии патологии лёгких при МВ генов, ответственных за формирование иммунного ответа (в частности, генов интерлейкина-4 (IL-4) и его рецептора), а также генов, кодирующих синтез оксида азота (NO) в организме.

Кариотипирование одного или обоих супругов

Кариотипирование — это исследование количественного набора хромосом, а также их структурных перестроек (хромосомных аберраций). Перестройки могут быть внутри- и межхромосомными, могут сопровождаться нарушением порядка фрагментов хромосом (делеции, дупликации, инверсии, транслокации). Хромосомные перестройки подразделяют на:

• Сбалансированные. Иинверсии, реципрокные транслокации не приводят к потере или добавлению генетического материала, поэтому их носители, как правило, фенотипически нормальны.
• Несбалансированные. Делеции и дупликации меняют дозовое соотношение генов, и, как правило, их носительство сопряжено с существенными отклонениями от нормы.

У здорового человека должно быть 22 пары аутосом и 1 пара половых хромосом (ХХ или ХУ). Для пар, страдающих от бесплодия, кариотипирование назначается скорее из-за перестраховки, его назначение более оправдано при привычном невынашивании, особенно если оно было связано с доказанной анеуплоидией эмбриона/ов.

У пациентов с бесплодием хромосомные перестройки встречаются редко. С привычным невынашиванием сбалансированные перестройки встречаются чаще, но занимают всего лишь 4–5% в структуре причин привычного невынашивания. При этом у таких пациентов всегда есть шанс на рождение здорового ребенка без проведения дорогостоящего обследования и лечения. Без соответствующих исследований и лечения риски повторного невынашивания и рождения ребенка с тяжелыми проявлениями несбалансированной транслокации существуют, но они достаточно низкие.

Так как анализ проводится на коммерческой основе, пара должна понимать, что выявление нарушений кариотипа повлечет за собой рекомендацию делать предимплантационную генетическую диагностику эмбрионов (ПГД) на конкретную хромосомную поломку, а также ПГТ-А для исключения численных хромосомных нарушений у эмбрионов.

ИССЛЕДОВАНИЕ КАРИОТИПА ЧЕЛОВЕКА, ЧТО ЭТО ЗА АНАЛИЗ?

Исследование кариотипа проводят с целью диагностики хромосомных синдромов. В норме у женщин  кариотип 46, ХХ; а  у мужчин  46,ХУ.
Кариотип – это описание хромосом соматических клеток организма (число, размер, форма, особенности строения) на стадии метафазы клеточного деления. Основой хромосом является ДНК – носитель генетической информации. Такой анализ имеет большое значение, позволяя диагностировать ряд хромосомных заболеваний, вызванных как грубыми нарушениями кариотипов (нарушение числа хромосом), так и нарушением хромосомной структуры или множественностью клеточных кариотипов в организме (мозаицизм).  Как правило, нарушения кариотипа у человека сопровождается множественными пороками развития,  большинство таких аномалий несовместимо с жизнью и приводят к самопроизвольным абортам на ранних стадиях беременности. Однако,  достаточно большое число плодов с аномальным кариотипом около 2,5% донашивается до окончания беременности и данная патология иногда может быть впервые выявлена только, например,  в репродуктивном возрасте при обследовании в связи с бесплодием.

Материал для исследования: цельная кровь.

Срок изготовления анализа: не менее 19 рабочих дней.

Например, некоторые болезни человека, вызванные аномалиями кариотипов: синдром Клайнфельтера; синдром Шерщевского-Тернера; полисомия по Х хромосоме; болезнь Дауна; синдром Эдварда; синдром Патау; синдром кошачьего крика.

Подготовка

Для получения необходимой информации от пациента требуется правильная подготовка к сдаче анализа:

Рекомендуется половое воздержание. Возможен половой акт с использованием презерватива (в течение трех дней перед проведением исследования)

Если проигнорировать рекомендации уролога, то в анализе будут выявлены в превышающем норму количестве лактобациллы, микроорганизмы, свойственные влагалищу партнерши.
Важно исключить прием алкоголя (три дня) и в течение 2-х недель не принимать антибактериальные препараты.
В день проведения анализа нельзя использовать антибактериальное мыло. Для гигиены половых органов нужно воспользоваться только теплой водой.

Как генетическое тестирование помогает будущим родителям

Атлас придерживается в работе нормативного документа Комиссии по генетике человека (A Common Framework of Principles for Direct-To-Consumer Genetic Testing Services). Это руководство содержит принципы предоставления услуг генетического тестирования, и направлен на поддержание стандартов, постоянства качества услуг и защиты интересов клиентов.

Для анализа результатов Атлас создал алгоритм, который сопоставляет данные из образцов с базой данных 318 наследственных заболеваний. Алгоритм анализирует полученную информацию на наличие вариантов генов, которые отвечают за риски для здоровья и статус носительства генетических заболеваний. Затем команда ученых-генетиков проверяет результаты, чтобы убедиться в корректности информации перед их загрузкой в личный кабинет.

Генетическое тестирование помогает будущим родителям узнать, есть ли у них статусы носительства одинаковых вариантов генов наследственных заболеваний, которые могут перейти к детям. Будет ребенок здоровым носителем заболевания или же оно проявится, зависит от типа болезни.

В личном кабинете в разделе Здоровье на странице Наследственные заболевания для каждой болезни есть описание и оценка рисков передачи детям. Результаты вашего генетического теста покажут один из трех вариантов носительства:

Выявлены варианты гена, связанные с заболеваниемДве красные хромосомы. Вы увидите рядом с названием знак вопроса. Нажмите на вопрос, чтобы ознакомиться с более подробной информацией.

Выявлен вариант гена, при котором вы являетесь здоровым носителемОдна хромосома будет отмечена красным, если заболевание аутосомно-рецессивное. Это значит, что на одной хромосоме у вас здоровый вариант гена, а на другой — вариант гена, связанный с заболеванием.

Вариант гена не выявленВы не являетесь носителем связанного с вариантом гена заболеванием.

Тест определяет многие, но не все существующие варианты каждого наследственного заболевания. Если в истории семьи были генетические заболевания — обсудите это на консультации с генетиком.

Материал для исследования

ВНИМАНИЕ! Для исключения искажений результатов определения состава микрофлоры урогенитального тракта мужчин из-за присутствия в урогенитальном тракте транзиторной микрофлоры в течение трех дней перед взятием биоматериала рекомендуется половое воздержание или защищенный половой контакт

• Для этиологической диагностики уретрита, баланопостита, мониторинга терапии данных заболеваний рекомендованными видами биологического материала являются: соскоб из уретры, соскоб с крайней плоти головки полового члена (ГПЧ), моча (первая порция утренней мочи используется только для идентификации патогенов).
• Для этиологической диагностики простатита, мужского бесплодия, мониторинга терапии данных заболеваний рекомендованными видами биологического материала являются: секрет (сок) простаты*, остаточная моча после массажа простаты, эякулят, биопсийный материал из ткани простаты.

*При подозрении на острый простатит выполнять массаж простаты категорически запрещено!

Интерпретация результатов исследования формируется согласно алгоритму (рис. 1).

Рис. 1. Принципиальная схема алгоритма автоматической трактовки результатов

Аналитическая чувствительность:

• для всех, кроме Mycoplasma genitalium, Trichomonas vaginalis, Neisseria gonorrhoeae, Chlamydia trachomatis, – 4000 копий/мл;
• для Mycoplasmagenitalium,Trichomonasvaginalis,Neisseriagonorrhoeae,Chlamydiatrachoma- tis – 1000 копий/мл.

Формат наборов: наборы раскапаны в стрипованные пробирки (8 шт. по 0,2 мл).

Температура хранения: компоненты набора следует хранить при температуре от 2 °С до 8 °С в течение всего срока годности.

Срок годности:12 месяцев.

Наборы реагентов для выделения ДНК: ПРОБА-НК-ПЛЮС; ПРОБА-ГС-ПЛЮС.

Оборудование, необходимое для проведения анализа: приборы серии ДТ производства ООО «НПО ДНК-Технология» (ДТлайт, ДТпрайм, ДТ-96).

Для проведения анализа с использованием стрипованных пробирок необходимо дополнительное оборудование: штатив и насадка на микроцентрифугу (вортекс) для стрипованного пластика.

Особенности набора:

• Одновременная детекция (мультиплексный анализ) – в одной пробирке определяется несколько ДНК-мишеней.
• Внутренний контрольный образец (ВК) присутствует в каждой пробирке с амплификационной смесью, необходим для контроля прохождения полимеразной цепной реакции.
• Геномная ДНК человека (ГДЧ) требуется для анализа качества взятия исследуемого материала.
• Маркер используется прибором для определения положения стрипованных пробирок (стрипов) в плашке.

Приборы серии ДТ производства компании «ДНК-Технология» оснащены специально разра- ботанным русскоязычным программным обеспечением (ПО), поддерживающим автоматическую обработку данных и выдачу результатов исследования в удобной для интерпретации форме (рис. 2).

Уникальные технические характеристики приборов позволяют существенно сократить общее время проведения анализа. Это значительно экономит время исследования и обеспечивает высокую пропускную способность лаборатории.

Существенным преимуществом ПО является возможность одновременной реализации качественного и количественного мультиплексного анализа.

Кроме того, программа позволяет выдавать результаты в удобной и наглядной форме для анализа полученных данных врачами-клиницистами (рис. 3).

Как берут биопат

Биоптат – материал, полученный посредством биопсии. Биопсия предстательной железы выполняется одним из способов:

• Через прямую кишку (трансректальная биопсия). За 30 минут до биопсии делается клизма. Пациент ложится на левый бок, прижимая колени к груди. Врач проводит ректальный осмотр пальцем, затем вводит зонд, внутри которого находится игла. После взятия нужного количества образцов зонд извлекают.
• Через уретру (трансуретральная биопсия). Процедура может выполняться под наркозом – местным или общим. Пациент ложится на спину, раздвигает бедра и сгибает ноги в коленях. Врач вставляет гибкую трубку, которая называется «цистоскоп», в конец пениса и проводит ее через мочеиспускательный канал до простаты. Через цистоскоп (с помощью миниатюрных инструментов) берутся образцы.
• Через небольшой разрез в промежности (трансперинеальная биопсия). Пациент располагается на боку с согнутыми коленями. Кожу между мошонкой и анусом обрабатывают антисептическим раствором, вводят местный анестетик. После онемения врач делает небольшой разрез в коже. С помощью шприца берутся образцы с различных частей простаты. Шов, как правило, накладывать не нужно.

МУКОВИСЦИДОЗ – МУТАЦИИ ГЕНА CFTR (14 МУ –ТАЦИЙ), ПОЧЕМУ РЕКОМЕНДУЮТ ДАННЫЙ АНАЛИЗ ПРИ МУЖСКОМ БЕСПЛОДИИ?

Исследование гена CFTR может иметь диагностическое значение, как у больных с клиническими проявлениями заболевания, так и  прогностическое значение с целью выявления носительства неблагоприятных мутаций у здоровых лиц, вступающих в брак и/или планирующих деторождение.

Мутации гена  CFTR являются наиболее  частой причиной  мужского бесплодия, связанного с врожденным одно- или двухсторонним нарушением проходимости или отсутствием семявыносящих протоков. Отсутствие семявыносящих протоков наблюдается у 2% бесплодных мужчин и 6% страдающих обструктивной азооспермией. Отличительная особенность спермограмм при различных мутациях гена муковисцидоза являются олигоастенотератозооспермия, изолированная олигозооспермия, азооспермия неясного генеза, сниженный объем семенной жидкости, отсутствие или низкая концентрация фруктозы, патологическая вязкость эякулята. Вследствие врожденной облитерации семенных протоков практически все мужчины, страдающие муковисцидозом, стерильны. У женщин , страдающих муковисцидозом, происходит образование густого спермицидного шеечного секрета, что уменьшает вероятность оплодотворения.

Материал для исследования: цельная кровь.

Срок исполнения анализа: не менее 19 рабочих дней.

Что показывает

Метод обнаруживает полезные микроорганизмы и патогенные, дает оценку состояния биоценоза (качественные и количественные изменения микрофлоры), а также определяет выраженность дисбаланса условно-патогенной и нормофлоры. Одно исследование с помощью теста Андрофлор заменяет комплекс методов ПЦР-РВ, расширяя его за счет дополнительной диагностики строгих анаэробов.

После получения анализов пациент направляется к урологу для постановки диагноза. Технология метода Андрофлор позволяет врачам быстро и точно ставить диагноз, корректировать лечение под конкретного человека, а также отслеживать его эффективность.

Описание

Y хромосома передаётся только по мужской линии — от отца к сыну. Гены, находящиеся на этой хромосоме, отвечают за формирования мужского пола у ребёнка, поэтому эта хромосома присутствует только у мужчин. Как и в случае с мтДНК, изменения в Y хромосоме происходят исключительно за счёт накопления мутаций.
Существует около 30 основных гаплогрупп по Y хромосоме, которые подразделяются на подргуппы и под-подгруппы. Считается, что все известные на сегодняшний день гаплогруппы возникли в результате накопления мутаций при передаче Y хромосомы по наследству от прародителя всех людей на Земле, так называемого «Y хромосомного Адама», который жил в Африке 200–300 тыс. лет назад. Разные народы и этнические группы отличаются друг от друга по гаплогруппам Y хромосомы, а также по соотношению гаплогрупп среди представителей этих народов и этнических групп.
 Показания:

• для установления родственной связи между двумя мужчинами или мужчиной и женщиной у предполагаемых родственников по мужской линии. Например, дед/бабка-внук, дядя/тетя-племянник, брат-сестра;
• при исследовании образцов десятилетней, столетней и даже тысячелетней давности;
• для определения принадлежности генетического профиля той или иной генеалогической ветви человечества (европейской гаплогруппе, африканской, ближневосточной, американской и т.д.). Таким образом, можно определить происхождение человека.

Подготовка
Обязательным условием проведения юридического ДНК-теста является ЕДИНОВРЕМЕННОЕ нахождение в клинике всех участников теста. Забор образцов делает специалист клиники.
Точность более 99,9% — требуется образец буккального эпителия (соскоб со щеки). Соскоб производится специальными ватными палочками из конверта.
За полтора часа до сбора образцов не принимать пищу и не курить. Непосредственно перед взятием образцов прополоскать рот теплой водой. Непосредственно перед взятием образцов вымыть руки.
При взятии образца у младенца подождать минимум полчаса с момента последнего кормления. Непосредственно перед взятием образца дать младенцу попить теплой воды из бутылочки для кормления.Процедура взятия ротового мазка

1. Взять один конверт для образцов ДНК и одну упаковку стерильных ватных палочек.
2. Написать на конверте сведения об образцах и указать 12-ти значный номер заказа, который находится под штрих-кодом на бланке заказа. Также указать на конверте номер образца и степень родства (например: № 1, отец).
3. Аккуратно открыть упаковку и извлечь ТОЛЬКО ОДНУ ватную палочку. Постараться избежать контакта наконечника ватной палочки с поверхностью рук и окружающими предметами.
4. Приоткрыть рот и аккуратно, с легким нажимом, потереть ватной палочкой внутреннюю сторону каждой щеки. Палочку рекомендуется слегка поворачивать и совершить ею не менее 10–15 движений. При взятии образца у младенца, не прилагать излишних усилий, чтобы не травмировать слизистую оболочку рта ребенка! 
5. Вложить палочку с взятым образцом в подготовленный конверт, но НЕ ЗАКЛЕИВАТЬ его.
6. Извлечь ВТОРУЮ ватную палочку из упаковки и повторить все действия, описанные выше.
7. Вложить ВТОРУЮ ватную палочку в тот же самый конверт и ЗАКЛЕИТЬ его. На этом этапе в конверте должны находиться ДВА образца, полученные от ОДНОГО человека.
8. Взять второй конверт для образцов ДНК и повторить все вышеописанные действия для второго человека, участвующего в тесте. Не забыть также указать на конверте номер заказа, номер образца и степень родства (например: №2, ребенок).
9. Если в анализе принимают участие более двух человек, можно заказать еще один набор и, взяв оттуда ТОЛЬКО ВАТНЫЕ ПАЛОЧКИ и КОНВЕРТЫ ДЛЯ ОБРАЗЦОВ ДНК, собрать дополнительные материалы, повторив вышеописанный процесс. Обязательно подписывать сведения об образцах на конвертах (например: №3, ребенок 2).
10. Поместить конверты с взятыми образцами и заполненный бланк заказа в прилагающийся к набору ОБЩИЙ конверт и отправить его в лабораторию. 

Доставка и хранение биоматериала:
Рекомендуется отправить образцы ДНК в день взятия биоматериала. Образцы гарантировано пригодны для генетического анализа в течение 2-х недель.
Если образцы полностью высохли до помещения в конверт, для предотвращения возникновения плесени, которая способна уничтожить ДНК, то они пригодны для генетического анализа в течение года. В таком виде образцы ДНК могут храниться без каких-либо изменений в течение многих лет.Условия выдачи результатов исследования
Результаты выдаются лично в руки в запечатанном конверте заказчику исследования, оплатившему заказ, по предъявлению паспорта, договора, квитанции об оплате.Оригинальный бланк будет изготовлен в течение 14 дней после выдачи электронного результата.

Диагностика муковисцидоза

Диагностическими критериями МВ у детей являются:

• Семейный анамнез (наличие в семье больных МВ).
• Результаты медико-генетического обследования(если родители информированы о возможном носительстве дефектного гена, им назначается ДНК-анализ. При выявлении мутации гена МВ супружеской паре рекомендуется консультация врача-генетика).
• Результаты пренатальной диагностики (проведение ДНК-анализа путем амниоцентеза в околоплодных водах позволяет на 18-20 неделе беременности в 90% случаев выявить патологию).
• Результаты постнатальной диагностики (скрининг новорожденных в роддоме).
• «Золотым стандартом» диагностики МВ является потовый тест, определяющий уровень хлоридов пота.
• Анализ крови на иммунореактивный трипсин.
• Определение химотрипсина в кале.
• Копрограмма (выявление нейтрального жира и мышечных волокон в кале).
• Стандартные лабораторные исследования: общий и биохимический анализ крови, общий анализ мочи, анализ кала на яйца гельминтов.
• Морфофункциональное исследование (УЗИ органов брюшной полости).
• Рентгенография органов грудной клетки (наличие бронхоэктазии, эмфиземы и ателектаза легких, пневмонии).
• Бронхоскопия (идентификация бронхоэктазов, обтурации дыхательных путей вязкой слизью).
• Исследование функции внешнего дыхания (спирография) – диагностика брохнообструктивного синдрома.
• Микроскопическое и бактериологическое исследование мокроты – для исключения или подтверждения бактериального инфицирования дыхательных путей и назначения адекватной антибактериальной (АБ) терапии.